Během prvních několika let své existence se stát snažil být uznán jako jediný nástupce Jugoslávie, ale ostatní bývalé sovětské republiky se proti těmto nárokům postavily. Organizace spojených národů odmítla žádost o zahrnutí Jugoslávie. Nakonec, po sesazení Slobodana Miloševiče jako prezidenta federace v roce 2000, země tyto aspirace opustila a přijala stanovisko Badinterova arbitrážního výboru ke společnému nástupnictví. Znovu požádal o členství v OSN dne 27. října a byl přijat dne 1. listopadu 2000.
Manuál
SRJ zpočátku vládl Slobodan Miloševič jako prezident Srbska (1989-1997) a poté prezident Jugoslávie (1997-2000). Miloševič dosadil a vynutil si odvolání několika federálních prezidentů (jako je Dobrica Cosic) a premiérů (jako je Milan Panic). Černohorská vláda, která zpočátku Miloševiče horlivě podporovala, však začala postupnědistancovat se od jeho politiky. To vedlo ke změně režimu v roce 1996, kdy jeho bývalý spojenec Milo Đukanović změnil svou politiku, stal se vůdcem černohorské vládnoucí strany a následně odvolal bývalého černohorského vůdce Momira Bulatoviće, který zůstal loajální Miloševićově vládě. Od té doby byl Bulatović jmenován do ústředních funkcí v Bělehradě (jako federální premiér), Đukanović nadále vládl Černé Hoře a dále ji izoloval od Srbska. Tedy od roku 1996 do roku 2006 Černá Hora a Srbsko byly nominálně jedinou zemí. Řízení ve všech možných politických, ekonomických a sociálních segmentech bylo prováděno na místní úrovni, v Bělehradě pro Srbsko a Podgorici pro Černou Horu.
Unie Srbska a Černé Hory
Jako volná unie nebo konfederace byly Srbsko a Černá Hora sjednoceny pouze v určitých oblastech, jako je obrana. Oba konstituční státy fungovaly po celou dobu existence Spolkové republiky odděleně a nadále fungovaly v rámci samostatné hospodářské politiky i používání samostatných měn (jediným zákonným platidlem v Černé Hoře bylo euro). 21. května 2006 se konalo referendum o nezávislosti Černé Hory, pro nezávislost se vyslovilo 55,5 % voličů. Poslední zbytky bývalé Jugoslávie, 88 let po jejím vzniku, skončily oficiálním vyhlášením nezávislosti Černé Hory 3. června 2006 a oficiálním vyhlášením nezávislosti Srbska 5. Červen. Po rozpuštění se Srbsko stalo právním nástupcem unie a nově nezávislá Černá Hora znovu požádala o členství v mezinárodních organizacích.
Následky katastrofy
Po rozpadu Jugoslávie v 90. letech souhlasily se zachováním jugoslávského státu pouze republiky Srbsko a Černá Hora a v roce 1992 přijaly novou ústavu pro novou Jugoslávii. Po pádu komunismu ve východní Evropě následoval nový stát po vlně demokratických změn. Opustilo komunistické symboly: ze státní vlajky byla odstraněna rudá hvězda a komunistický erb byl nahrazen bílým dvouhlavým orlem s erby Srbska a Černé Hory uvnitř. Nový stát také vytvořil jednočlenný úřad prezidenta, původně jmenovaný se souhlasem republik Srbska a Černé Hory až do roku 1997, poté byl prezident demokraticky zvolen.
Vytvoření Svazové republiky Jugoslávie
S rozpadem Jugoslávie a jejích institucí v letech 1991 až 1992 vyvstala otázka jednoty dvou republik, které zůstaly v rozpadající se federaci: Srbska, Černé Hory; stejně jako území se srbskou většinou v Chorvatsku a Bosně, která chtěla zůstat jednotná. V roce 1991 se v důsledku diplomatických jednání vedených lordem Carringtonem se šesti vůdci všechny republiky s výjimkou Srbska dohodly, že se Jugoslávie rozpadla a každá její autonomní část by se měla stát samostatným státem. Srbská vláda byla překvapena a pobouřena rozhodnutím Černé Hory o ukončeníJugoslávie, protože Bulatovičova vláda byla dříve úzce spojena s Miloševičovou vládou v Srbsku. Rozpad Jugoslávie začal v roce 1991, kdy Slovinsko, Chorvatsko a Makedonie vyhlásily nezávislost. Poté vznikla Svazová republika Jugoslávie.
Třetí Jugoslávie
26. prosince 1991 se Srbsko, Černá Hora a srbská povstalecká území v Chorvatsku dohodly, že vytvoří novou „třetí Jugoslávii“. V roce 1991 bylo rovněž vyvinuto úsilí o začlenění eserské Bosny a Hercegoviny do federace, kde probíhají jednání mezi Miloševičem, Srbskou demokratickou stranou Bosny a zastáncem sjednocení Bosny, bosenským místopředsedou Adilem Zulfikarpasičem. Zulfikarpašić věřil, že Bosna by mohla těžit ze spojení se Srbskem a Černou Horou, proto podporoval alianci, která by zajistila jednotu Srbů a Bosňáků. Vlajka Svazové republiky Jugoslávie se nijak nelišila od své předchůdkyně.
Miloševič pokračoval v jednání se Zulfikarpasicem o začlenění Bosny do nové Jugoslávie. Snahy o začlenění celé Bosny do nové Jugoslávie však do konce roku 1991, kdy Izetbegović plánoval uspořádat referendum o nezávislosti, zatímco bosenští Srbové a bosenští Chorvaté vytvořili autonomní území, fakticky vyhasly.
Hádka mezi bratrskými národy
Od roku 1996 první veřejné známky politických neshod mezi nimičásti černohorského a srbského vedení. V roce 1998, kdy se černohorský premiér Milo Đukanović dostal do popředí v mocenském boji s černohorským prezidentem Momirem Bulatovićem, prováděla republika jinou hospodářskou politiku a jako měnu přijala německou marku. Na podzim roku 1999, po válce v Kosovu a bombardovací kampani NATO, Đukanović (který již pevně držel moc v Černé Hoře, protože Bulatović byl zcela sesazen) připravil návrh dokumentu s názvem Platforma za redefiniciju odnosa Crne Gorei Srbije („Platforma pro federální Republika Jugoslávie ), vyzývající k zásadním změnám v rozdělení administrativních povinností v rámci FR Jugoslávie, ačkoli stále oficiálně vidí Černou Horu jako společný stát se Srbskem. Miloševič na Platformu neodpověděl a považoval ji za protiústavní.
Růst napětí
Politické vztahy ve federálním státě byly stále napjatější, zejména na pozadí vlny atentátů na přední politické, kriminální a státní podnikatelské osobnosti v obou republikách (Zeljko „Arkan“Rozhnatovic, Pavle Bulatovic, Chika Petrovic a Goran Žugić) a také dva pokusy o život opozičního politika Vuka Draškoviće. V říjnu 2000 Miloševič ztratil moc v Srbsku. Navzdory očekávání Đukanovićanovou reakcí na změnu moci v Bělehradě nebylo další prosazování agendy stanovené v jeho „Platformě“, ale náhlé zahájení prosazování plné nezávislosti, čímžv procesu ho úplně vyřadit. Následné vlády Černé Hory prosazovaly politiku nezávislosti a politické napětí se Srbskem vřelo navzdory politickým změnám v Bělehradě. Všechny tyto vášně byly přirozeným výsledkem historie vzniku Svazové republiky Jugoslávie.
Založení konfederace
V roce 2002 Srbsko a Černá Hora uzavřely novou dohodu o pokračování spolupráce, která kromě jiných změn slibovala konec Jugoslávie. Obě země byly dříve součástí Svazové republiky Jugoslávie. 4. února 2003 federální shromáždění Jugoslávie vytvořilo svobodný státní svazek, neboli konfederaci, Státní svaz Srbska a Černé Hory. Bylo dosaženo dohody o nové ústavní listině, která by poskytla základ pro vládnutí země.
Nezávislost Černé Hory
V neděli 21. května 2006 hlasovali Černohorci v referendu o nezávislosti. 55,5 % podpořilo nezávislost. Takový počet hlasů „ano“byl nutný pro rozpuštění Jugoslávie. Účast byla 86,3 % a platných bylo 99,73 % z více než 477 000 odevzdaných hlasů.
Následné vyhlášení nezávislosti Černou Horou (v červnu 2006) a Srbskem (5. června) ukončilo konfederaci Jugoslávie a tím i poslední zbývající zbytky federativní republiky.
Hospodářský rozvoj Svazové republiky Jugoslávie
Stát výrazně ekonomicky utrpěl kolapsem a neefektivním řízením ekonomiky ataké prodloužené období ekonomických sankcí. Na počátku 90. let trpěla SRJ hyperinflací jugoslávského dináru. Do poloviny 90. let 20. století SRJ překonala inflaci. Další škody na jugoslávské infrastruktuře a průmyslu způsobené válkou v Kosovu způsobily, že ekonomika byla pouze poloviční než v roce 1990. Po sesazení bývalého federálního jugoslávského prezidenta Slobodana Miloševiče v říjnu 2000 zavedla koaliční vláda Demokratické opozice Srbska (DOS) stabilizační opatření a pustila se do agresivního programu reformy trhu. Po obnovení členství v Mezinárodním měnovém fondu v prosinci 2000 Jugoslávie pokračovala v reintegraci se zbytkem světa připojením se ke Světové bance a Evropské bance pro obnovu a rozvoj.
Menší Republika Černá Hora oddělila svou ekonomiku od federální kontroly a od Srbska během Miloševičovy éry. Následně měly obě republiky samostatné centrální banky, zatímco Černá Hora začala používat různé měny: nejprve přijala značku Deutsch a používala ji, dokud se nerozpadla a nebyla nahrazena eurem. Srbsko nadále používalo jugoslávský dinár a přejmenovalo jej na srbský dinár.
Složitost politických vztahů ve SRJ, pomalý pokrok v privatizaci a stagnace v evropské ekonomice poškodily ekonomiku. Ujednání s MMF, zejména požadavky na finanční kázeň, byly důležitými prvky tvorby politiky. Byla vážná nezaměstnanostklíčové politické a ekonomické téma. Korupce je také hlavním problémem velkého černého trhu a vysokého stupně kriminální angažovanosti ve formální ekonomice.
