Vytvoření eukaryotické buňky bylo druhou nejdůležitější (po vzniku života samotného) evoluční událostí. Hlavním a zásadním rozdílem mezi eukaryoty a prokaryotními organismy je přítomnost pokročilejšího genomového systému. Díky vzhledu a vývoji buněčného jádra prudce vzrostl stupeň adaptability jednobuněčných organismů na pravidelně se měnící podmínky existence a schopnost rychle se adaptovat bez zavádění významných dědičných změn do genového systému.
Eukaryotická buňka, jejíž cytoplazma je oblastí aktivních metabolických procesů, úspěšně oddělená od zóny ukládání, čtení a reduplikace genetické informace, se ukázala jako schopná další biologické evoluce. Tato epochální a osudová evoluční událost se podle vědců odehrála nejpozději před 2,6 miliardami let na křižovatce dvou geologických milníků – archeanu a proterozoika.
Růst adaptability a stability biologických struktur je nepostradatelnou podmínkou pro plnohodnotnou biologickou evoluci. Právě díky své vysoké schopnosti adaptace se eukaryotická buňka dokázala vyvinout v mnohobuněčné organismy se složitou strukturní organizací. V mnohobuněčných biologických systémech totiž buňky se stejným genomem, adaptující se na měnící se podmínky, tvoří tkáně, které jsou zcela odlišné, a to jak svými morfologickými vlastnostmi, tak i funkčností. Toto je velké evoluční vítězství eukaryot, které vedlo ke vzniku tak grandiózní rozmanitosti forem života na planetě a vstupu do evoluční arény samotného člověka.
Struktura buněk eukaryotického typu má několik charakteristických rysů, které nejsou charakteristické pro prokaryota. Eukaryotická buňka obsahuje velké množství genetického materiálu (90 %), který je koncentrován v chromozomálních strukturách, což zajišťuje jejich diferenciaci a specializaci. Každá eukaryotická buňka je charakterizována přítomností samostatného jádra. To je hlavní rozlišovací znak tohoto typu buněk. Dalším důležitým rozdílem od prokaryot jsou organely eukaryotické buňky – konstantní a různorodé intracelulární struktury.
Eukaryotická buňka má ve srovnání s prokaryotickou buňkou složitější vícestupňový systém vnímání různých látek. V přírodě neexistuje typická univerzální buňka eukaryotického typu. Všichnivyznačující se neuvěřitelnou rozmanitostí, která je dána právě potřebou evoluční adaptace. Velmi důležitou vlastností eukaryot je jejich inherentní kompartmentalizace – lokalizace všech biochemických procesů v samostatných buněčných kompartmentech oddělených intracelulární membránou. Eukaryota mají řadu složitých strukturních složek. Jako je membránový systém; cytoplazmatická matrice, která je hlavní intracelulární látkou; buněčné organely jsou hlavní funkční složky eukaryot.
