V biologii, pro popis konkrétního organismu, který patří do říše zvířat, hub nebo rostlin, byla vyvinuta jeho vlastní nomenklatura. Odráží příslušnost k jednomu druhu v závislosti na vlastnostech morfologie a vzhledu. U zvířat se použijí kritéria pro označení druhu v závislosti na schopnosti produkovat plodné potomstvo během oplodnění. Tyto vzorce však platí pouze pro tyto organismy, zatímco mikroby nelze tímto způsobem klasifikovat.
Koncept kmene v mikrobiologii
Vzhledem k přítomnosti velkého množství organismů, které mají morfologické vlastnosti, ale odlišné biochemické a imunologické vlastnosti, není možné použít standardní nomenklaturu pro pojmenování. V důsledku toho byl představen takový koncept jako kmen. Toto je čistá kultura mikrobů, která byla izolována a izolována na určitém místě v určitou hodinu.
Každý mikrob, který patří k jednomu kmenu, je podobný jinému takovému zástupci z hlediska biochemických, morfologických, imunologických a genetických kritérií. Ale u stejného bakteriálního druhu taková analogie není pozorována. Proto je kmen flexibilnějším názvem pro mikrobiální kulturu. Protože rychlevýměna genetického materiálu (mutace) vede ke vzniku nových organismů v rámci druhu, ale s odlišnými vlastnostmi, právě tato definice nám umožňuje přesněji charakterizovat faktory patogenity a virulence.
Bakteriální kmeny
Stávající nomenklatura bakterií umožňuje klasifikovat typy organismů, ale necharakterizuje jejich nové vlastnosti. Ty se objevují jako důsledek rychlé mutace, získávání nových vlastností, včetně těch, které jsou patogenní pro lidi, hospodářská zvířata a rostliny, stejně jako pro jiné mikroby. Příklad názvosloví na příkladu Escherichia coli vypadá takto: říše - bakterie, typ - Proteobakterie, třída gama-proteobakterií, řád - Enterobacteriales, čeleď Enterobacteria. Rod je Escherichia a druh je Escherichia colli. Existuje však mnoho kultur bakterií druhu Escherichia colli, které vykazují různé vlastnosti. Jsou izolovány do samostatných kmenů bakterií a mají další název. Například Escherichia colli O157:H7.
E. coli je sama o sobě přítomna v lidském střevě a nezpůsobuje onemocnění, ale kmen O157:H7 je výhradně patogenní kvůli přítomnosti velkého množství faktorů virulence. Za posledních 5 let zažila epidemii enterotoxigenních onemocnění.
Kmeny viru
Pojem kmen je flexibilní název pro organismy se stejnými vlastnostmi, které byly izolovány a poté identifikovány a popsány v určité oblasti v určitou dobu. Svým průběhem může virus získat nové vlastnosti díky antigennímdriftovat. To vytvoří nový virový kmen, možná patogeničtější než jeho původní kmen.
Výskyt nových kmenů můžete jasně ukázat na příkladu viru chřipky. Patří do rodiny orthomyxovirů a je pojmenován v závislosti na antigenech (hemaglutininy a neuraminidáza) HxNy. X a Y jsou číselné hodnoty odrážející přítomnost antigenů. Příkladem je H5N1, známý pro nedávnou epidemii prasečí chřipky s rychle progredujícími hemoragickými pneumoniemi. Podle teorie se z tohoto kmene může vyvinout nový a nebezpečnější kmen v důsledku stejného antigenního driftu.
Kmeny plísní a kmeny protist
Písně jsou ze všech mikrobů nejméně variabilní, ačkoli jejich biochemie je také složitá. Kvůli složitější struktuře než bakterie a viry a také kvůli nedostatku mechanismů pro rychlý přenos genů se počet nových kmenů hub mírně zvyšuje. Existuje také názor, že každý nově objevený plísňový kmen je již existujícím organismem, se kterým se výzkumníci jednoduše nesetkali.
Podobná situace existuje v království protistů. Jejich schopnost mutovat je nízká, takže pravděpodobnost, že se rychle objeví nové kmeny, je extrémně malá. Stále se však objevují nové varianty organismů stejného druhu. Proto zřejmě také existovaly dříve, ale nebyly objeveny.
