Deoxyribóza je 5-uhlíkový monosacharid (pentóza), který vzniká z ribózy, když ztratí jeden atom kyslíku. Empirický chemický vzorec pro deoxyribózu je C5H10O4 a kvůli ztrátě atom kyslíku, nesouhlasí s obecným vzorcem pro monosacharidy (CH2O) , kde n je celé číslo.
Fyzikální a chemické vlastnosti
Lineární vzorec pro deoxyribózu může být reprezentován následovně: H-(C=O)–(CH2)–(CHOH)3-H. Existuje však také ve formě uzavřeného kruhu atomů uhlíku.
Deoxyribóza je bezbarvá pevná látka, která je bez zápachu a je vysoce rozpustná ve vodě. Jeho molekulová hmotnost je 134,13 g/mol, bod tání 91 °C. Získává se z ribosa-5-fosfátu působením příslušných enzymů během redukční chemické reakce.
Rozdíl mezi ribózou a deoxyribózou
Jak již bylo zmíněno a jak název napovídá, deoxyribóza je chemická sloučenina, jejíž atomové složení se od ribózy liší pouze jedním atomem kyslíku. Jak je znázorněnona obrázku níže deoxyribóza nemá na svém druhém atomu uhlíku hydroxylovou skupinu OH.
Deoxyribóza je součástí řetězce DNA (deoxyribonukleové kyseliny), zatímco ribóza je součástí řetězce RNA (ribonukleové kyseliny).
Je zajímavé poznamenat, že monosacharidy arabinóza a ribóza jsou stereoizomery, to znamená, že se liší prostorovým uspořádáním vzhledem k rovině kruhu skupiny OH poblíž 2. atomu uhlíku. Deoxyarabinóza a deoxyribóza jsou stejné sloučeniny, ale používá se druhý název, protože tato molekula je odvozena od ribózy.
Deoxyribóza a genetické informace
Protože je deoxyribóza součástí řetězce DNA, hraje důležitou biologickou roli. DNA – zdroj genetické informace, sestává z nukleotidů, mezi které patří deoxyribóza. Molekuly deoxyribózy spojují jeden nukleotid s druhým v řetězci DNA prostřednictvím fosfátových skupin.
Zjistilo se, že nepřítomnost hydroxylové skupiny OH v deoxyribóze poskytuje mechanickou flexibilitu celému řetězci DNA ve srovnání s RNA, což zase umožňuje molekule DNA vytvořit dvouvláknový řetězec a být v kompaktní formě uvnitř buněčné jádro.
Navíc díky pružnosti vazeb mezi nukleotidy tvořenými molekulami deoxyribózy a fosfátovými skupinami je řetězec DNA mnohem delší než RNA. Tato skutečnost umožňuje zakódovat genetickou informaci s vysokou hustotou.
